2009年11月14日 星期六

波長準確度在核酸定量方法的重要性

波長準確度在核酸定量方法的重要性

http://tw.myblog.yahoo.com/platereader-platereader/article?mid=524&prev=550&l=a&fid=5

名牌及3 C產品大家多少都有看過所謂的相似產品,
前陣子公司的TECAN小姐竟然也在某Reader競爭廠牌網站看到極為相似 TECAN Infinite NanoQuant 微量定量模組  
大家還記得Infinite NanoQuant嗎? TECAN專利設計全球第一台可整合於多功能微盤分析儀的微量定量模組,內鑲16個石英材質的小孔徑,可同時精密定量16個2 μl 微量核酸或是蛋白質樣品,甚至是可支援標定螢光樣品的定量。




看到競爭廠牌推出相似版的微量定量模組,其實TECAN是暗自竊喜的,因為TECAN這項專利也大大證實,整合多功能微盤分析儀的微量定量模組是一個非常成功的商品,只需2μl體積即可同時定量16個核酸樣品,提供使用者更便利快速的方法進行DNA定量。



然而,相似產品多少都有正版所無法超越的規格限制 ,微孔盤分析儀專家TECAN在設計Infinite NanoQuant時,考量到進行DNA定量的時候,波長精確度對於微量核酸定量來說是一項非常重要的規格;大家都知道,核酸樣品之所以要同時判讀260以及280波長,是因為要計算DNA純度(DNA 260/280 Ratio),DNA純度對於實驗重要性,可由核酸樣品的全波長掃描曲線看出。

這是一般溶於二次水中的DNA樣品於全波長掃描下的吸收曲線

DNA於偵測A260區間是屬與較平均的鐘型波峰,而於A280區間則是比較陡峭的曲線

容許誤差較大的機型可能偵測到其他不必要波長下的吸光值

這在A260的吸光值或許因中型分布而影響不大

但是在A280陡峭的吸光曲線下則會得到很大的誤差


加上計算純度公式A280為分母,所以誤差大的分母會使得純度值誤差被放的更大






簡單來說 在以O.D A260/A280 偵測核酸檢體技術上

波長精確度越小,可以得到越準確的值,避免其他波長所造成的不穩定誤差

而如果機器波長精確度較差的話,加上DNA判讀後所得到的OD數值其實都不高,所以一些些的波長偏差,對於後續的DNA純度計算一定都會造成放大的錯誤數值。

TECAN Infinite 系列儀器,波長精確度規格為如下

小於 315 nm波長範圍,波長精確度為± 0.3 nm (就是指DNA的260/280判讀波長囉)

大於315 nm,波長精確度為0.5 nm;

相較於其他市售全波長機種當中,波長精確度多為2 nm



另外在跟大家說明一下,TECAN在DNA定量,260/280 Ratio精確度規格趨近於±0.07,如此優異的光學設計,我想TECAN應該是相當有自信不怕任何仿效產品的。




<部分內容來自Tecan小姐的部落格>

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